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倪柝声的祖父倪玉成（1840～1890年）是福州闽侯人，是福建当地最早的华人信徒之一。1853年，倪玉成就读于美部会传教士卢公明（Justus Doolittle，1824～1880）开办的教会学校，后在传教士的影响下于1857年10月受洗成为信徒，并自1862年至1890年担任福州南台铺前顶救主堂牧师。在担任牧师期间，倪玉成与粤籍妻子育有七子五女共十二个孩子，七个儿子分别为：倪文明、倪文斌、倪文彩、倪文修、倪文德、倪文超、倪文钦，其中倪柝声的父亲倪文修（1877～1941）是倪玉成的四子。
作为传教士主导下的华人牧师，倪玉成有机会接触到当时华人较少涉及的西人西物，这使他比当时的华人民众有更开阔的知识面与视野。或许是由于父亲自身的牧师身份，倪文修从小就读于福州著名教会学校鹤龄英华书院，接受西式教育，精通英文。同时，倪文修也接受中国传统教育，参加并通过了科举考试，得以在汕头海关任职，薪资不菲。
倪文修就读的学校——福州鹤龄英华书院
虽然有一份看似不错的工作，但倪文修的婚姻却屡屡受挫。一面，当时婚姻全凭父母做主的时代，13岁就丧父的倪文修，失去了最有可能为他安排婚姻的人。另一面，倪文修在十一位兄弟姐妹排行第四，加上性格温和，并不引人注目。另外，当时排斥洋教的大背景下，出生于基督徒家庭的倪文修并不受一般华人传统家庭欢迎。
1880年，倪柝声的母亲林和平生于一个贫民家里。生父因家中生活艰难，且深受重男轻女观念影响，便把她林和平送给福州南台福利洋行林姓富商收养。林姓富商与妻子甚爱这个孩子，待其长大后送入美以美会开办的毓英女校接受西式教育。1896年，林和平有意去美国学医，在父亲的帮助下，于次年前往上海中西女塾先学习英文。由于母亲担心她去到外国后不回家，便焦急地希望她早点结婚。恰好这时，倪文修的母亲前来为子说媒，得到林家父母的许可。1899年10月19日，倪文修与林和平在福州结婚。之后生有五子四女，长幼顺序如下：倪闺臣、倪闺贞、倪柝声、倪怀祖、倪绳祖、倪洪祖、倪兴祖、倪天菁和倪天婷。
林和平就读的教会学校——毓英女校
婚后，林和平住在夫家约两周，便感受到夫家与婆家的不同。林和平上有婆婆，下有七个伯叔，五个大小姑，家庭关系复杂。从小在家受到百般宠爱的林和平立志说，“日后我必将女儿嫁尽了，方为儿子娶妇，以免为媳的痛苦”。之后不久，二人便回到汕头，后又调往苏州海关。
1911年时逢革命军起事，林和平积极参加爱国运动。不仅把首饰、金手镯奉献国家；也不顾性命安危，到处演说，吸引许多男女跟随。闽政府以其成绩可嘉，孙道仁都督特为请奖于北京政府，结果授予林和平二等爱国勋章。后来林氏又通函各界妇女组织，组织妇女爱国会，孙道仁都督夫人为会长，潘寿松夫人为副会长，林氏被举为总干事。孙中山来闽时，闽政府请林氏作为特别招待员接待。
倪文修写诗歌：
救主本是真神，屈身下降凡尘，投胎处女为人，代人受死赎罪救灵。
今日是何日，救主降生时，救主今降生，大小赞美他，马槽之婴孩，
基督平安望，诸侯来跪拜，荣耀何等辉煌。
阿利路亚！阿利路亚！阿利路亚！荣耀，阿们！
倪文修子女生平简述如下：
倪柝声的大姐倪闺臣后来嫁给陈献章，生有一子陈终道。陈终道年轻时就读于贾玉铭神学院，后在香港担任牧师，创办金灯台出版社及刊物。1949年以后，陈终道历任印尼、香港、南洋等地神学院新旧约圣经讲师，晚年在温哥华担任牧师。
倪柝声的二姐倪闺贞嫁给福州知名基督徒林步基。林步基的祖父林永标原是闽北乡村的一名渔夫，年近半百却没有儿子，为此结婚两次，仍然无子，觉得愧对祖宗。一次在传教士的影响下半信半疑祷告，结果在50岁那年生了儿子林叨安，后来成为传教士的厨子，举家搬到福州。林叨安在传教士的帮助下成为福州塔亭医院首位华人医生，同时任福州青年会副会长。林叨安注重教育，将儿子林步基送入圣约翰大学就读。1918年，林步基在传教士的帮助下到费城留学，先后从当地的神学院和宾州大学获得了学位。后在父母的安排下，与倪闺贞结婚。1927年，林步基任福州圣公会苍霞基督堂首任座堂牧师。1929年，转任福州三一中学校长。1930—1932年，任开封私立豫中中学首任校长，后来又定居上海。林步基的儿子林保民追随父亲脚步，在费城留学，成为天普大学医院的神经科医生，后与一名意大利裔女子结婚，育有多名儿女，其中长女名为林珍妮。
倪柝声的弟弟倪怀祖毕业于圣约翰大学化学系，于1937年创办生化药厂。他的妻子徐奉先，是安徽一个内地会牧师的次女。这位牧师有三个女儿：徐凤翔、徐奉先、徐恩秀，其中徐奉先和徐恩秀两姐妹，分别嫁给了倪怀祖与倪兴祖两兄弟。这位牧师的孙子徐腓力，后来娶了张愚之的三女儿张乐晨为妻。
倪柝声是倪文修的长子，林和平头两个孩子都是女儿，在当时重男轻女的家庭，颇为婆婆轻视。林和平再怀孕时，便求神给她一个儿子，以除去羞耻。结果生了倪柝声，长大后被送入圣公会开办的极具水准的三一书院学习。该书院以注重英语而出名，英语学习的科目就有会话、作文、默写、语法、翻译、读本、文学等课程，而且教师也用英文授课，并且需要学习多年，这对倪柝声以后熟读西方神学著作奠定了基础。
倪柝声就读的学校——圣公会三一书院
倪氏的家族谱系如下：
倪氏家族图
（笔者综合各类资料绘制而成）
